产品货号:
RFT316
中文名称:
单链DNA Ladder(15~120nt)
英文名称:
ssDNA Marker(15-120nt)
产品规格:
10T
发货周期:
1~3天
产品价格:
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本制品由6条不同长度的单链DNA分子混合而成,6个条带的大小为15,40、60、80、100、120nt,其中80nt浓度为0.4μg/μL,其余条带浓度为0.2μg/μL。
单链DNA Ladder(15~120nt)适用于跑尿素变性胶,电泳后使用单链DNA PAGE电泳染色试剂盒,核酸PAGE电泳染色试剂盒、核酸快速染色试剂盒或RealGood类核酸染料染色均可以得到清晰的条带分离效果。
组分 | 规格 |
单链DNA Ladder(15~120nt) | 50μL |
2×TBE尿素上样缓冲液 | 1mL |
保存:-20℃,有效期2年。
以下使用方法均以8×10cm凝胶厚1.0mm示例,其他规格凝胶请适当调整。
- 凝胶制备
- 可以选择DNA尿素PAGE电泳试剂盒或按照以下程序制胶:
表一、TBE-尿素PAGE分离胶配方表(总体积5mL,适用于厚度1.0mm小板胶)
最后加入10%APS和TEMD后,立即混匀。单链DNA长度 最佳凝胶浓度 尿素 40% PAA(29:1) 5×TBE 补水到总体积 10% APS TEMED 200~1000nt 5% 2.1g 0.625mL 1mL 5mL 50μL 5μL 50~400nt 8% 1mL 30~300nt 10% 1.25mL 10~150nt 15% 1.875mL - 在凝胶模具中灌入适量分离胶溶液(对于mini-gel,凝胶液加至约距前玻璃板顶端1.5cm或距梳齿约0.5cm即可),然后在分离胶溶液上轻轻覆盖一层1~5cm的水层,使凝胶表面保持平整。
- 静置10~20分钟,待分离胶和水层之间出现一个清晰的界面后,说明凝胶已聚合。
- 凝胶的聚合时间与环境温度有关。夏天温度较高时,聚合较快;冬天气温低时,聚合时间会延长。可以根据环境温度的不同调节APS的加入量。
- 去除覆盖在分离胶上的水层;按照表二将不同体积成分在一个小烧杯中混合;最后加入10%过硫酸铵和TEMED,轻轻搅拌使其混匀,避免产生气泡。
表二、TBE-尿素PAGE 4%浓缩配方表(总体积2mL,适用于1.0mm厚度胶)凝胶浓度 尿素 40% PAA(29:1) 5×TBE 灭菌水 10% APS TEMED 4% 0.84g 0.2mL 0.4mL 补水至体积2mL 20μL 2μL - 将浓缩胶溶液加至分离胶的上面,直至凝胶溶液到达前玻璃板的顶端;将梳子插入凝胶内,避免产生气泡。
- 静置30~60分钟,等待浓缩胶聚合。
- 凝胶的聚合时间与环境温度有关。夏天温度较高时,聚合较快;冬天气温低时,聚合时间会延长。可以根据环境温度的不同调节APS的加入量。
- 可以选择DNA尿素PAGE电泳试剂盒或按照以下程序制胶:
- 样品制备
- 取适量体积单链DNA Ladder样品,70℃处理5分钟,冰浴制冷后待上样;待测样品序与2×TBE尿素上样缓冲液等体积混合后70℃处理5分钟,冰浴制冷后待上样。
- 电泳
- 预电泳(可选):电泳槽内外加入适量1×TBE缓冲液稳压200 V预电泳30分钟。电泳结束后,用1×TBE缓冲液彻底冲洗加样孔2~3次,去除残余的尿素。
- 上样:根据梳齿确定Marker上样量,一般是10齿1mm厚梳子上样5μL,15齿1mm厚梳子上样3μL。
- 连接电源线,打开电源开关,按照以下条件电泳。
恒电压 起始电流 结束电流 电泳时间 适用条件 200V 15-20mA/板胶 10-15mA/板胶 60+ min 最佳电压,最优的分辨率 - 等待上样缓冲液的溴酚蓝指示前沿到凝胶底部时终止电泳,取出凝胶进行后续实验。
变性胶浓度 溴酚蓝 二甲苯菁 5% 35nt 130nt 8% 19nt 75nt 10% 15nt 55nt 15% 8nt 42nt
- 预电泳(可选):电泳槽内外加入适量1×TBE缓冲液稳压200 V预电泳30分钟。电泳结束后,用1×TBE缓冲液彻底冲洗加样孔2~3次,去除残余的尿素。
- 染色
- 使用单链DNA PAGE电泳染色试剂盒(货号:RFT204),核酸PAGE电泳染色试剂盒(货号:RFT205)或核酸快速染色试剂盒(货号:RFT206)染色均可以得到清晰的条带分离效果。
- 如果使用核酸染料染色,RealGood Red(货号:RFT232)或RealGood All(货号:RFT270)核酸染料结合单链核酸效果最佳,强烈建议使用以便获得最佳效果的胶图。其余染料如GelRed,Goldview,EB等染色效果不好。
- 使用单链DNA PAGE电泳染色试剂盒(货号:RFT204),核酸PAGE电泳染色试剂盒(货号:RFT205)或核酸快速染色试剂盒(货号:RFT206)染色均可以得到清晰的条带分离效果。
15% TBE-Urea PAGE
电泳条件:1×TBE 200V 17-9mA 65min
染色:RealGood Red后染20min
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